内部控制的方法主要有：
一、建立合理有效的内部控制体系：完善会计体系、财务管理体系、安全管理体系、信息系统管理体系及绩效考核体系。
二、严格执行企业规章制度：按照规章制度建立内部控制制度，落实制度和规章，提高规章制度的执行力，使企业管理更加制度化。
三、完善部门内控机制：建立合理的部门内控机制，落实财务职权，实行职责分工，健全内部审计制度。加强财务管理，进行日常内部检查、定期审计和年度审计，对财务活动进行跟踪评估，帮助企业实现风险管理和企业发展。
四、建立完善的内部控制报告制度：经理报告和经理审批制度等，以及完善的内部控制评估制度，全面分析内部控制的强度，及时改进。
五、构建安全的信息系统：安全的信息系统有助于企业实现对内部控制的有效监控，建立完整的数据备份管理和安全保护措施，防止数据的被篡改、损坏等。
拓展知识：
内部控制不仅仅是管理措施，更多的是一种文化，企业内部更要强化责任意识，提高员工素质。引进先进管理方法，提高管理水平，加强企业绩效考核与强制执行，科学管理，激发员工的积极性和创新精神。企业还可以采用信息通讯技术，将信息系统与生产销售系统结合起来，实现实时监控与反馈，加强企业的管理能力。